Bien, pues siempre hay necesidad de cambiar de formato, por ejemplo los archivos .flv que son los que bajamos de yuotube 
, aquí les dejo unas instrucciones usando ffmpeg y un programa que encontré en la red que se llama mobile media converter que nos sirve para pasar archivos 3gp a mpeg o avi en una interfaz gráfica.
primero los archivos flv, avi o mpeg (el -s nos dará el tamaño al que deseamos, si queremos que conserve la misma resolución del original no lo ponemos el “-s 640×480″)
para video
$ ffmpeg -i video.flv -s 640x480 video.avi
$ ffmpeg -i video.flv -s 640x480 video.mpeg
$ ffmpeg -i video.flv -s 640x480 video.mpeg
$ ffmpeg -i video.mpeg video.avi
$ ffmpeg -i video.wmv video.avi
Para este ultimo de WMV asegurarte de tener el paquete de w32codecs
Para audio
$ ffmpeg -i archivo.mp3 archivo.wave
$ ffmpeg -i archivo.mp3 archivo.ogg
$ ffmpeg -i archivo.ogg archivo.mp3
Estos son unos ejemplos de uso mas común, para mas informacion puedes ver aqui
Ahora le toca a los 3gp y demás con Interfaces graficas, tenemos que bajar este programa llamado Mobil Media Converter
y lo obtenemos asi
$ wget http://www.miksoft.net/products/mmc-lin.tar.gz
lo extraemos
$ tar -zxvf mmc-lin.tar.gz
ya hora lo ejecutas
$ cd mmc-lin
./Mobile\ Media\ Converter
Nos abrirá una interface gráfica que soporta darg&drop lo que significa que solo arrastramos el archivo a convertir a donde dice input file y todo listo le pones clcik en convertir y lo ahora todo…
En este puedes pasar tus archivos mp3, avi, mpeg o 3gp etc directamente, el programa te lo pasara en auto al codec que quieras, o puedes seleccionar cual quiera que desees
En lo personal prefiero mi shell 
pero este ayuda mucho
